O CAPA Santa Cruz do Sul (RS) desenvolve seu trabalho prioritariamente junto a grupos de agricultores e agricultoras familiares, destacando a inclusão de gênero e de diferentes gerações. Também atua junto a alguns grupos urbanos e indígenas, escolas e universidades, com destaque para as Escolas Família Agrícola e Colégio Teutônia e abertura de espaços especiais para inclusão da juventude nas suas atividades.
Baseia sua atuação na troca de saberes, reconhecendo e respeitando os conhecimentos dos públicos beneficiários, com agregação do saber técnico-científico.
Os principais temas que orientam enfocados no trabalho são agroecologia, organização cooperativa, agroindústria familiar, comercialização, sociobiodiversidade, meliponicultura, resgate e preservação de sementes crioulas, educação para promoção da saúde, com enfoque nas plantas bioativas, alimentação saudável e saúde comunitária.