Os municípios onde o CAPA Santa Cruz do Sul (RS) tem atuação direta são:
Arroio do Meio, Cachoeira do Sul, Candelária, Cruzeiro do Sul, Dona Francisca, Itaara, Lajeado, Novo Cabrais, Paraíso do Sul, Paverama, Rio Pardo, Salto do Jacuí, Santa Clara do Sul, Santa Cruz do Sul, Santa Maria, Sinimbú, Teutonia, Vale do Sol, Venâncio Aires, Vera Cruz e Westfalia.
O núcleo acompanha as seguintes cooperativas e grupos de agricultoras e de agricultores:
- Cooperativa Regional de Agricultores Familiares Ecologistas Ltda. (Ecovale)
