O Conselho do CAPA Marechal Cândido Rondon é composto de representantes da Igreja Evangélica de Confissão Luterana no Brasil e de grupos de agricultoras e de agricultores. Neste momento, integram o conselho:
Conselho Administrativo
- Ademar Giese
- Ester Delene Wilke, Sínodo Rio Paraná
- Lauro Eloi Fleck, Sínodo Rio Paraná
- Lorita Sonntag, Organização de Público Beneficiário/ACEMPRE (Associação Central dos Produtores Rurais Ecológicos)
- Nelvi Krause
Membro Ofício
- Afonso Weimer, pastor sinodal, Sínodo Rio Paraná
- Mário Maass, vice-presidente, vice-pastor sinodal, Sínodo Rio Paraná
Membro Nato
- Lauri Roberto Becker